增值税对小规模纳税人采用简易征收办法，对小规模纳税人适用的税率称为征收率。不能像一般纳税纳税人那样，销售货物可以抵扣购进商品的进项税，购进商品的税款只能计入商品成本中，小规模商贸企业按销售额乘以3%征收率计算应纳税款。
简单举例
甲小规模商贸企业本月购入商品50件，每件单价800.00元,货款40000.00元，已通过银行付款。
一、购进商品会计处理
借：库存商品40000.00
贷：银行存款40000.00
二、销售商品会计处理
当月销售20件商品，取得货款20000.00元，已通过银行收款。
借：银行存款20000.00元
贷：主营业务收入19417.48
应交税费——应交增值税582.52
三、结转销售成本会计处理
本企业采用月末一次加权平均法结转销售成本，假设期初商品数量为0，计算加权平均单位成本=（0+40000）/(0+50)=800.00元。本月销售20件商品。
借：主营业务成本16000.00（20*800）
贷：库存商品16000.00
在采购过程中，可能货到了，发票未到，只能暂估入账。暂估的商品销售后，没有发票的成本也随之结转了，这个是有税务风险的。最好及时催促，收回发票。最晚不可超过当年的汇算清缴，否则成本得做纳税调增处理。
小规模企业和一般纳税人企业，在进销存产品成本上的记账方法，区别就在于含税价入账和不含税价入账，其它流程、手续等都一样。
小规模企业是指年营业额在规定限额以下，会计核算不健全，即不能准确计算购进进项税额和销售的销项税额，以及应缴纳增值税额，所以实行简易征收增值税。
因此，小规模企业在科目设置上也简单一些，在“应交税金”下设“应交增值税”，则无需再往下设置三级增值税相关科目。
购入商品时，应按发票上含税金额计入库存商品，不用管进项税额，因为不能认证抵扣。同样销售时（发出商品）结转成本，也按照含税金额进入成本。具体如下：
购入：
借：库存商品（含税）
贷：应付账款/银行存款/现金
销售：
借：应收账款
贷：主营业务收入（销售额97%）
贷：应交税金——应交增值税（销售额3%）
结转：
借：主营业务成本（含税）
贷：库存商品（含税）
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