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STM32软件工程师和linxu软件工程师，都是使用C语言进行程序开发，但linux可以分为linux驱动开发和linux应用开发。
linux比STM32难度大
linux开发比STM32软件开发要复杂，从事linux开发，需要学习linxu gcc和shell指令，makefile编程，系统移植，文件系统，linux驱动，QT等等相关知识，门槛比stm32开发难度高。需要掌握的知识点更多更复杂。学习难度非常大。
linux就业前景
学习stm32的工程师，等到工作年限，一定会遇到职业瓶颈，这个时候，如果你会linux开发，操作系统，那么职业道路将会走的很宽，二则，工作待遇来讲，普遍linux开发会比STM32开发的福利待遇要好一些。
选择linux或者STM32，是分情况来选择的
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如果本身有一定的linux系统基础，那么强烈建议选择linux，因为linux整体工资要比stm32开发要高。学完linux后，如果项目需要stm32单片机，那么再去做STM32，会觉得十分简单。
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如果没有任何的linux基础，公司没有师傅带着做linux的话，或者公司对linux项目有较高的要求和时间限制，那么不建议转linux，先将STM32学好，再过半年一年后，自学合作参加培训linux。不至于打击学习的自信心，二则对于后续找工作也有一定的好处，至少有一项技能能够在毕业后找到工作。
总之，因为处在即将毕业的时间点，先要根据自身条件，结合自己的兴趣爱好，保障毕业能够找到好工作为前提
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我觉得，刚出来实习的话最好就是能找到一个能让你成长的平台。但前提是你现在所拥有的知识和技术是否能够让你所选择的提供职位的公司能够录用你。
STM32与Linux两者都是属于嵌入式，而后者比前这更高级，目标可以订在Linux，STM32只是一个过渡，两者的相关理论都是有所系系，初始阶段可以先通过STM32来搞明白常用的一些外设，STM32搞明白了，自己的编程能力那也就提升了，再入手Linux也就简单多了，如果你一开始就入手Linux的话估计会比较难而且复杂。
就我自己来说，刚实习的时候找了一份搞STM32的硬件开发工程师的职位，这也是找了一个多月才找到的一份工作，这也是因为我拿出了我画的不咋地的一份PCB设计才被录用下来的。
录用我的公司是一家小公司，一开始就是做一些设备的组装和画一下PCB这些工作，因为我的C语言编程能力实在是太差了，在大学学的是8051的单片机，而且学的也不怎么样。所以看到STM32程序项目的程序那么多看明白的就没几行。后来我通过stn32开发板提供的配套视频教程了解了整个程序项目的结构和作用后，就看得懂了，那时就可以改改程序了。后来来就不单单是搞硬件了，什么都要搞。最后公司所使用的产品性能要升级，就用到了Linux，一开始老板安排工作直接叫我在Linux上用qt开发一个软件，当时我就愣了一下，因为我都没搞过C++。而且还说没完成要追究责任。没办法只能硬着头皮开干了。用了两天去了解QT项目工程的结构。最后搞了两个多月算是完成了，过程中搞过Linux内核编译，底层驱动移植，驱动添加等等，感觉在这段时间学到了很多。
所以说STM32到Linux只是一个过程，是一个由浅入深的过程。如何抉择先看你自己现在能力在那个阶段。
嵌入式软件开发领域，主要分为MCU开发和SOC开发两个大类别。具体的细分情况如下图所示。其中，MCU开发主要涉及到一般的RTOS系统开发，而SOC开发就具体需要Linux操作系统的支持了。
嵌入式软件开发岗位分类
题主上面问题中，STM32属于MCU开发的范畴，而嵌入式Linux 开发是属于SOC开发的范畴。两个领域来说，编程语言都是标准的C语言；MCU与SOC芯片硬件差异有，但是不是影响开发的因素。两者主要的区别在于：Linux操作系统远远复杂于STM32上常见的RTOS操作系统。而且，在Linux 开发领域，还更加细分为应用开发与BSP驱动开发两个子类别。
所以说，Linux开发的复杂度远远高于STM32上RTOS的软件开发。至于如何选择，需要题主根据自身的技术能力（是否有Linux的开发经验），参考个人的技术发展方向（未来从事MCU还是SOC），具体问题具体分析来决定。
根据答主的嵌入式开发经历，如果题主对Linux操作系统没有开发经历。建议您选择从STM32的RTOS系统开发做起，然后扩展到嵌入式Linux的应用开发，最后在涉足Linux的BSP开发的技术发展道路。这个也是答主，以及很多朋友的常见技术发展道路。
以上仅代表个人建议，仅供题主参考。
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